Det er Kollegiekontoret, som er administrator for de selvejende kollegier. Det betyder bl.a., at Kollegiekontoret udfører opgaver for kollegierne f.eks. at.:
- udleje boligerne
- sørge for, at beboerrådets, bestyrelsens og beboermødets beslutninger føres ud i livet
- udarbejde budgetter og regnskaber
- holde sig a jour med ændringer i lovgrundlaget
Boligorganisationen, Kollegiekontoret S.m.b.a. er organiseret som et garantiselskab, De selvejende kollegier har indskudt kapital og har således medejerskab i Kollegiekontoret S.m.b.a. Det betyder bl.a., at der er to beboere fra de selvejende kollegier som sidder i boligorganisationens bestyrelse og repræsentantskab. Beboerne på de selvejende kollegier har således – sammen med beboerne på alle Kollegiekontorets kollegier (afdelinger) - indflydelse på boligorganisationen overordnede beslutninger og drift.